Die Sicherheit der Daten basiert auf zwei Faktoren:
Zum ersten sind die Daten auf der Karte mit dem AES-256 Verschlüsselungsstandard geschützt. Ein so verschlüsselter Datensatz kann nicht in realistischer Zeit dechiffriert werden.
Zum zweiten werden neben der PIN des Benutzers ein einmaliger Aktivierungscode und eine generierte Zufallszahl verwendet, um die PIN-SAFE Karte fest mit dem jeweiligen Smartphone zu koppeln. Der Schlüssel besteht also nicht nur aus der PIN, sondern auch dem Smartphone. Nur beides in Kombination ist in der Lage die Karte zu entsperren.